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学院历史悠久。水产学院的办学历史可追溯到创建于1935年的广东省立高级水产职业学校设立的渔捞科、养殖科，是1997年1月湛江水产学院与湛江农业专科学校实行实质性合并组建湛江海洋大学后学校设立的首批二级学院之一。2005年，学院随学校更名为广东海洋大学水产学院。【详情】

经济学院的前身是1997年成立的原湛江海洋大学经济贸易系（由原湛江农业专科学校的农业经济管理系和原湛江水产学院的社科系合并而成），2000年更名为经济管理学院。2016年6月学校调整学院设置和优化学科专业布局时，成立经济学院。【详情】

学院于2016年7月由原经济管理学院拆分成立，拥有7个本科专业和2个硕士学位授权点，形成了学科专业体系相对完善、师资力量较强、人才培养质量和社会影响不断提升的良好局面。【详情】

广东海洋大学滨海农业学院，前身为始建于1958年的华南农学院湛江分院，1980年转设湛江农业专科学校，1997年转为湛江海洋大学农学院，2005年更名为广东海洋大学农学院，2019年更名为广东海洋大学滨海农业学院。院名由我校特聘院士、世界“杂交水稻之父”袁隆平院士题写。【详情】

电子与信息工程学院是学校为加快推进特色鲜明高水平海洋大学的建设，于2016年6月整合原信息学院、理学院和海洋与气象学院相关学科专业而成立的。【详情】

2001年6月文法学院法律系成立。2004年10月法学院成立；2005年4月成立政治与行政学院，2016年6月法学院与政治与行政学院合并为法政学院。【详情】

机械工程学院起源于1935年成立的国立广东水产专科学校的轮机科，历经“工程学院”“机械与动力工程学院”数度更名发展至今，是广东海洋大学具有鲜明工科特色的学院之一，已有40多年的本科教育办学历史，培养了一大批高素质的工程技术人才。【详情】

食品科技学院始于1950年广东省立高级水产技术学校加工科，1977年国家恢复高考后开始招收首届本科生，1999年开始招收硕士研究生，从2002年开始与中国科学院联合培养博士研究生，2014年开始招收食品科学与工程专业博士研究生。【详情】

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